ফরিদপুর জেলার মধুখালী উপজেলা ১১টি ইউনিয়ন নিয়ে প্রতিষ্ঠা হয়।
মধুখালী উপজেলার উত্তরে বালিয়াকান্দি উপজেলা, দক্ষিণাংশে মাগুরা সদর ও বোয়ালমারি উপজেলা, পশ্চিমে বালিয়াকান্দি ও শ্রীপুর উপজেলা, পূর্বে ফরিদপুর সদর উপজেলা। পূর্বে গোয়ালন্দ মহকুমার অধীনে ছিল। পরবর্তীতে ফরিদপুর জেলার একটি উপজেলা হিসাবে এর যাত্রা শুরু হয় ।
এ উপজেলার নামকরণ নিয়ে ভিন্ন মত প্রচলিত আছে। এক সময় এখানে প্রচুর মধু পাওয়া যেত এজন্য এ উপজেলার নাম মধুখালী হয়েছে বলে জানা যায় ।
পরিকল্পনা ও বাস্তবায়নে: মন্ত্রিপরিষদ বিভাগ, এটুআই, বিসিসি, ডিওআইসিটি ও বেসিস